Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11236J3QMS7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms