Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms