Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20830J3KML6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms