Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm29394H3BIW7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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