Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4bG5E8Z2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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