Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfgef1G3X9K3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfgef1G3X9K3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms