Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp72F8VQC1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms