Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28048F7BCN0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28048F7BCN0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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