Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm7933-201ENSMUST00000191215 2255 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ovch2-201ENSMUST00000106755 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms