Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms