Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm8247F6VRJ8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm8247F6VRJ8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm8247F6VRJ8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm8247F6VRJ8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm8247F6VRJ8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm8247F6VRJ8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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