Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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