Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms