Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm340F6RGI3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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