Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa35E9QLQ1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms