Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms