Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Urb2E9Q7L1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms