Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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