Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
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ApobE9Q414 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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ApobE9Q414 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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ApobE9Q414 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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ApobE9Q414 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
ApobE9Q414 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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