Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt78E9Q0F0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms