Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20425E9Q035 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms