Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx60E9PZQ1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms