Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms