Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gm3543D3Z235 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gm3543D3Z235 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3543D3Z235 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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