Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf217D3YYI7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms