Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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