Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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