Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms