Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usf3B2RUQ2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms