Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms