Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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H2-M5A7VMS3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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