Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Atp8b5A3FIN4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Atp8b5A3FIN4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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