Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms