Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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