Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmpd1A2AKB4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms