Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms