Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb4A2A863 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb4A2A863 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms