Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
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