Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms