Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms