Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cldn9Q9Z0S7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cldn9Q9Z0S7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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