Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnip1Q9WUU8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnip1Q9WUU8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnip1Q9WUU8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnip1Q9WUU8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnip1Q9WUU8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnip1Q9WUU8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnip1Q9WUU8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnip1Q9WUU8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnip1Q9WUU8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms