Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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