Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nphs1Q9QZS7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nphs1Q9QZS7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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