Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpc3Q9QZC1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms