Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn8Q9QZ49 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms