Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp1Q9QY53 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms