Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms