Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ChmQ9QXG2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms