Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms